Inimese soolestikus elab umbes 100 triljonit mikroorganismi, mis moodustavad soolestiku mikrobioomi. See keerukas ökosüsteem mõjutab seedimist, immuunsüsteemi, ainevahetust ja isegi meeleolu. Tervislik mikrobioomi tasakaal tähendab kasulike bakterite ülekaalu kahjulike üle.
Paljud tegurid häirivad soolestiku mikrofloorat — antibiootikumid, stress, ebatervislik toitumine, alkohol ja reisimine. Probiootikumid on elusad kasulikud bakterid, mis aitavad taastada ja hoida tervislikku tasakaalu. Erinevad bakteritüved toetavad erinevaid funktsioone.
Uuemad teadusuuringud näitavad, et soolestiku mikrobioomi seisund mõjutab palju enamat kui seedimist. Nn "soole-aju telg" on kahesuunaline kommunikatsioonisüsteem soolestiku ja aju vahel. Terve mikrofloora toetab serotoniini tootmist (umbes 90% serotoniinist toodetakse soolestikus), meeleolu reguleerimist ja isegi kognitiivset funktsiooni.